MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 93864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006834	GATG	2	8	44	51	25 %	25 %	50 %	0 %	58579624
2	NC_006834	CCCG	2	8	89	96	0 %	0 %	25 %	75 %	58579624
3	NC_006834	GCA	2	6	400	405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
4	NC_006834	GCC	2	6	420	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579624
5	NC_006834	TGT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579624
6	NC_006834	GCA	2	6	484	489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
7	NC_006834	CGG	2	6	520	525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579624
8	NC_006834	TTC	2	6	585	590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579624
9	NC_006834	GAT	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579624
10	NC_006834	CAG	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
11	NC_006834	CGA	2	6	671	676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
12	NC_006834	TTC	2	6	684	689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579624
13	NC_006834	TTC	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579624
14	NC_006834	GCC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579624
15	NC_006834	ATC	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579624
16	NC_006834	CG	3	6	784	789	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
17	NC_006834	GTCG	2	8	839	846	0 %	25 %	50 %	25 %	58579624
18	NC_006834	CGAT	2	8	847	854	25 %	25 %	25 %	25 %	58579624
19	NC_006834	CCG	2	6	855	860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579624
20	NC_006834	CGA	2	6	923	928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579624
21	NC_006834	AAG	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579624
22	NC_006834	GC	3	6	982	987	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
23	NC_006834	TGG	2	6	997	1002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579624
24	NC_006834	CG	3	6	1003	1008	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
25	NC_006834	GC	4	8	1070	1077	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
26	NC_006834	ACT	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579624
27	NC_006834	GCCG	2	8	1257	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	58579624
28	NC_006834	ACCAC	2	10	1267	1276	40 %	0 %	0 %	60 %	58579624
29	NC_006834	TGC	2	6	1279	1284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579624
30	NC_006834	TGCC	2	8	1286	1293	0 %	25 %	25 %	50 %	58579624
31	NC_006834	CCTG	2	8	1728	1735	0 %	25 %	25 %	50 %	58579625
32	NC_006834	GGAC	2	8	1764	1771	25 %	0 %	50 %	25 %	58579625
33	NC_006834	CG	3	6	1812	1817	0 %	0 %	50 %	50 %	58579625
34	NC_006834	GGA	2	6	1827	1832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58579625
35	NC_006834	ACC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579625
36	NC_006834	CCCG	2	8	1858	1865	0 %	0 %	25 %	75 %	58579625
37	NC_006834	GC	3	6	1884	1889	0 %	0 %	50 %	50 %	58579625
38	NC_006834	CTGC	2	8	1978	1985	0 %	25 %	25 %	50 %	58579625
39	NC_006834	CCGT	2	8	1996	2003	0 %	25 %	25 %	50 %	58579625
40	NC_006834	GTG	3	9	2029	2037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579625
41	NC_006834	CAG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579625
42	NC_006834	CTA	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579625
43	NC_006834	CTG	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579625
44	NC_006834	TGC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579625
45	NC_006834	GGC	2	6	2209	2214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579625
46	NC_006834	ATC	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579625
47	NC_006834	GCT	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579625
48	NC_006834	TGCG	2	8	2438	2445	0 %	25 %	50 %	25 %	58579625
49	NC_006834	GC	3	6	2454	2459	0 %	0 %	50 %	50 %	58579625
50	NC_006834	CGAA	2	8	2471	2478	50 %	0 %	25 %	25 %	58579625
51	NC_006834	AAG	3	9	2546	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579625
52	NC_006834	CGA	2	6	2586	2591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579625
53	NC_006834	CAG	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579625
54	NC_006834	TCG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579626
55	NC_006834	CAA	2	6	4186	4191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579626
56	NC_006834	TGGAA	2	10	4217	4226	40 %	20 %	40 %	0 %	58579626
57	NC_006834	GGC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579626
58	NC_006834	TGC	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579626
59	NC_006834	TG	3	6	4337	4342	0 %	50 %	50 %	0 %	58579626
60	NC_006834	GTG	2	6	4354	4359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579626
61	NC_006834	GCG	2	6	4391	4396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579626
62	NC_006834	GTG	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579626
63	NC_006834	CCG	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579626
64	NC_006834	GC	4	8	4479	4486	0 %	0 %	50 %	50 %	58579626
65	NC_006834	GC	3	6	4517	4522	0 %	0 %	50 %	50 %	58579626
66	NC_006834	CG	3	6	4777	4782	0 %	0 %	50 %	50 %	58579626
67	NC_006834	CAAGC	2	10	4837	4846	40 %	0 %	20 %	40 %	58579626
68	NC_006834	GCCT	2	8	4858	4865	0 %	25 %	25 %	50 %	58579626
69	NC_006834	AGA	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579626
70	NC_006834	AGCGA	2	10	4895	4904	40 %	0 %	40 %	20 %	58579626
71	NC_006834	GAC	2	6	4924	4929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579626
72	NC_006834	CAC	2	6	4951	4956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579626
73	NC_006834	GC	3	6	4960	4965	0 %	0 %	50 %	50 %	58579626
74	NC_006834	CCCG	2	8	5022	5029	0 %	0 %	25 %	75 %	58579626
75	NC_006834	C	6	6	5155	5160	0 %	0 %	0 %	100 %	58579627
76	NC_006834	TGT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579627
77	NC_006834	CGA	2	6	5230	5235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
78	NC_006834	TGC	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
79	NC_006834	GGT	2	6	5380	5385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579627
80	NC_006834	CGA	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
81	NC_006834	CGA	2	6	5422	5427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
82	NC_006834	GAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579627
83	NC_006834	TGC	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
84	NC_006834	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
85	NC_006834	CGA	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
86	NC_006834	CGG	2	6	5590	5595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
87	NC_006834	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579627
88	NC_006834	CAG	2	6	5678	5683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
89	NC_006834	AGC	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
90	NC_006834	CAC	2	6	5746	5751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579627
91	NC_006834	GGCGC	2	10	5812	5821	0 %	0 %	60 %	40 %	58579627
92	NC_006834	CGA	2	6	5869	5874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
93	NC_006834	CGA	2	6	5893	5898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
94	NC_006834	GGC	2	6	5912	5917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
95	NC_006834	CGC	2	6	5955	5960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
96	NC_006834	TGG	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579627
97	NC_006834	CAA	2	6	6064	6069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579627
98	NC_006834	GGC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
99	NC_006834	CCGCG	2	10	6109	6118	0 %	0 %	40 %	60 %	58579627
100	NC_006834	CG	3	6	6123	6128	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
101	NC_006834	GAC	2	6	6191	6196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
102	NC_006834	CGG	2	6	6294	6299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
103	NC_006834	GC	3	6	6317	6322	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
104	NC_006834	CGAA	2	8	6348	6355	50 %	0 %	25 %	25 %	58579627
105	NC_006834	TCG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
106	NC_006834	CG	3	6	6388	6393	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
107	NC_006834	GC	3	6	6395	6400	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
108	NC_006834	CG	3	6	6406	6411	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
109	NC_006834	GC	3	6	6416	6421	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
110	NC_006834	CGC	2	6	6431	6436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
111	NC_006834	GC	3	6	6441	6446	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
112	NC_006834	TGC	2	6	6582	6587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
113	NC_006834	GC	3	6	6620	6625	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
114	NC_006834	CGA	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
115	NC_006834	ACC	2	6	6723	6728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579627
116	NC_006834	CAT	2	6	6730	6735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579627
117	NC_006834	TGA	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579627
118	NC_006834	CCGACG	2	12	6744	6755	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	58579627
119	NC_006834	CTT	2	6	6790	6795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579627
120	NC_006834	CTACAT	2	12	6829	6840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579627
121	NC_006834	GCC	2	6	6847	6852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
122	NC_006834	GCG	2	6	6944	6949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
123	NC_006834	CGA	2	6	6964	6969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
124	NC_006834	GCC	2	6	6970	6975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
125	NC_006834	ACT	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579627
126	NC_006834	GC	3	6	7037	7042	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
127	NC_006834	GCC	2	6	7090	7095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
128	NC_006834	GCAG	2	8	7153	7160	25 %	0 %	50 %	25 %	58579627
129	NC_006834	CG	3	6	7186	7191	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
130	NC_006834	TGG	2	6	7239	7244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579627
131	NC_006834	CCG	2	6	7249	7254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
132	NC_006834	GAA	2	6	7265	7270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579627
133	NC_006834	TGC	2	6	7281	7286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
134	NC_006834	GCG	2	6	7305	7310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579627
135	NC_006834	GC	3	6	7365	7370	0 %	0 %	50 %	50 %	58579627
136	NC_006834	CAA	2	6	7384	7389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58579627
137	NC_006834	GCT	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579627
138	NC_006834	AAG	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579627
139	NC_006834	GCC	2	6	7452	7457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
140	NC_006834	AGC	2	6	7497	7502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579627
141	NC_006834	ACC	2	6	7511	7516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579627
142	NC_006834	GCC	2	6	7568	7573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
143	NC_006834	CGC	2	6	7616	7621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579627
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145	NC_006834	GCT	2	6	7793	7798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
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149	NC_006834	TGT	2	6	8032	8037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58579628
150	NC_006834	ACT	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579628
151	NC_006834	CGT	2	6	8046	8051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
152	NC_006834	CTG	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
153	NC_006834	CG	3	6	8090	8095	0 %	0 %	50 %	50 %	58579628
154	NC_006834	CGC	2	6	8129	8134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579628
155	NC_006834	GAA	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58579628
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157	NC_006834	GAG	2	6	8286	8291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58579628
158	NC_006834	CTG	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
159	NC_006834	CCG	2	6	8300	8305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579628
160	NC_006834	GCCG	2	8	8331	8338	0 %	0 %	50 %	50 %	58579628
161	NC_006834	GCC	2	6	8418	8423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579628
162	NC_006834	GCA	2	6	8449	8454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579628
163	NC_006834	GCG	2	6	8460	8465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58579628
164	NC_006834	TGC	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579628
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172	NC_006834	TGG	2	6	8974	8979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579629
173	NC_006834	GCC	2	6	8987	8992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579629
174	NC_006834	TCG	2	6	9028	9033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579629
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234	NC_006834	GTCG	2	8	11717	11724	0 %	25 %	50 %	25 %	58579631
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239	NC_006834	CCT	2	6	12109	12114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58579632
240	NC_006834	TCA	2	6	12127	12132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579632
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243	NC_006834	CAC	2	6	12291	12296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58579632
244	NC_006834	GC	3	6	12299	12304	0 %	0 %	50 %	50 %	58579632
245	NC_006834	GCA	2	6	12310	12315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579632
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249	NC_006834	GGTG	2	8	12542	12549	0 %	25 %	75 %	0 %	58579632
250	NC_006834	TCG	2	6	12580	12585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579632
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252	NC_006834	CTT	2	6	12677	12682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58579632
253	NC_006834	CG	3	6	12694	12699	0 %	0 %	50 %	50 %	58579632
254	NC_006834	AGT	2	6	12763	12768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58579633
255	NC_006834	TGC	2	6	12830	12835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58579633
256	NC_006834	ATC	2	6	12838	12843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579633
257	NC_006834	TCA	2	6	12845	12850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579633
258	NC_006834	GAAG	2	8	12912	12919	50 %	0 %	50 %	0 %	58579633
259	NC_006834	CGCGC	2	10	12931	12940	0 %	0 %	40 %	60 %	58579633
260	NC_006834	ACG	2	6	12983	12988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579633
261	NC_006834	GCA	2	6	13030	13035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579633
262	NC_006834	CAG	2	6	13036	13041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58579633
263	NC_006834	GCC	2	6	13050	13055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58579633
264	NC_006834	TGG	2	6	13194	13199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58579634
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266	NC_006834	ATC	2	6	13264	13269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58579634
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